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Text File  |  1995-03-04  |  2.1 KB  |  42 lines
  1. *********************************************************************
  2. * Bacterial ring hydroxylating dioxygenases alpha-subunit signature *
  3. *********************************************************************
  4.  
  5. Bacterial  ring  hydroxylating  dioxygenases   are   multicomponent  enzymatic
  6. complexes  composed  of a  hydroxylase  component  and  an  electron  transfer
  7. component. The hydroxylase component is  itself  composed  of two subunits: an
  8. alpha-subunit of about 50 Kd, and a beta-subunit of about 20 Kd.  The electron
  9. transfer component  is  either  composed of two subunits:  a  ferredoxin and a
  10. ferredoxin reductase or by a single bifunctional ferredoxin/reductase subunit.
  11.  
  12. The alpha-subunit of hydroxylase components are evolutionary related [1].  The
  13. currently known members of this family are listed below.
  14.  
  15.  - Benzene 1,2-dioxygenase (EC 1.14.12.3) (gene bnzA) from Pseudomonas putida.
  16.  - Benzoate 1,2-dioxygenase  (EC 1.14.12.10)  (gene benA)  from  Acinetobacter
  17.    calcoaceticus.
  18.  - Naphthalene 1,2-dioxygenase  (EC 1.14.12.12) (gene ndoC)  from  Pseudomonas
  19.    putida.
  20.  - Toluate 1,2-dioxygenase (EC 1.14.12.-) (gene xylX) from Pseudomonas putida.
  21.  - Toluene 1,2-dioxygenase  (EC 1.14.12.11)  (gene todC1)   from   Pseudomonas
  22.    putida.
  23.  
  24. The alpha-subunit of the hydroxylase components bind  both a 2Fe-2S type iron-
  25. sulfur center and an iron atom.  There is,  in the N-terminal section of these
  26. proteins, a conserved  region  of 24 residues which contains two cysteines and
  27. two histidines  which  could  be  involved  in  the binding of the iron-sulfur
  28. center. We have used this region has a signature pattern.
  29.  
  30. -Consensus pattern: C-x-H-R-G-x(8)-G-N-x(5)-C-x-[FY]-H
  31.                     [The two C's and the two H's are putative 2Fe2S ligands]
  32. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  33. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  34.  
  35. -Expert(s) to contact by email: Harayama S.
  36.                                 sharayam@ddbj.nig.ac.jp
  37.  
  38. -Last update: October 1993 / Text revised.
  39.  
  40. [ 1] Neidle E.L., Hartnett C., Ornston N.L., Bairoch A., Rekik M., Harayama S.
  41.      J. Bacteriol. 173:5385-5395(1991).
  42.